Фамилия Илькуев — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она тюркская по корню, но с русским или русифицированным окончанием. Разберёмся по порядку.

Основа фамилии — «Илькуй». Это личное имя или прозвище. В тюркских языках, особенно в башкирском и татарском, есть имя Илькужа (Илкужа), где «ил» — «родина, страна», а «кужа» — «хозяин». Получается «хозяин страны». Фамилия Илькуев могла возникнуть как сокращённая или упрощённая форма от такого полного имени: Илькужа → Илькуй. Суффикс «-ев» — стандартный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность («чей?»). То есть Илькуев — буквально «сын Илькуя».

Вторая, менее вероятная версия — от имени Илько, которое в некоторых говорах могло звучать как Илькуй. Илько — уменьшительное от Илья, но тогда фамилия скорее писалась бы как Ильков. Вариант с «у» указывает на тюркское влияние, где звук «у» част в личных именах.

Географически фамилия Илькуев встречается в основном на Урале и в Поволжье — в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской области. Это подтверждает тюркскую версию: предки носителя фамилии, вероятно, были башкирами или татарами, которые после крещения или в ходе межэтнических контактов получили фамилию по имени отца, оформленную по русскому образцу.

Сословная принадлежность предков неясна, но в тех краях крестьяне и военные сословия (например, башкирские казаки) часто брали фамилии именно по отцу. Если Илькуй был прозвищем, то могло оно означать не только «хозяин страны», но и, в переносном смысле, «зажиточный, властный человек». Однако без документальных подтверждений это лишь догадка.

Главное отличие фамилии — её редкость и сохранение тюркского корня в русской оболочке. Она не переделана в Ильков или Илькин, а осталась с характерным «у», что ценно для историка: это след живой речи, где имя Илькуй бытовало реально, а не было выдумано при переписи.