Фамилия Иордан чаще всего восходит к личному имени Иордан, а не напрямую к названию реки. Имя это было распространено в среде крещёных евреев, а также у православных и католиков, особенно в Византии и на Балканах. Буквальное значение древнееврейского имени, от которого оно образовано, — «спустившийся». Связь с рекой Иордан, протекающей в Палестине и священной для христиан и иудеев, здесь вторична: имя давали в честь крещения в Иордане, а не как географическое прозвище.

Река Иордан впервые упоминается в египетских папирусах ещё с XIII века до нашей эры. В Библии она неразрывно связана с Иерихоном: именно близ этого города, согласно Писанию, Иехошуа Бин Нун (Иисус Навин) перевёл еврейский народ через реку по чудесно расступившемуся дну. Эта история закрепила за рекой символику перехода и обновления, что и сделало имя Иордан популярным в христианском мире.

Модель образования фамилии проста: имя Иордан без изменений стало фамилией. Это характерно для раннего пласта русских фамилий, особенно среди духовенства и выходцев из южнославянских земель. В русской традиции фамилии на -ов/-ев и -ин встречаются чаще, но форма без суффикса (Иордан) тоже не редкость. Она указывает либо на позднюю фиксацию фамилии, либо на её искусственное происхождение — например, в семинарской среде, где будущим священникам давали фамилии по библейским именам.

Географически фамилия Иордан встречается в России нечасто, но заметна в среде потомков духовенства, а также у греков, молдаван и румын, где имя Иордан (Иордаке) было обычным. Встречаются варианты написания: Иордан, Иорданов, Иордановский, а также южнославянские Йордан и Йорданов. Все они восходят к одному корню, но разное оформление суффиксов и окончаний подсказывает, в какой именно среде фамилия сложилась.