Фамилия Ипатенко — яркий представитель украинской модели фамилий на -енко, характерной для Поднепровья и Левобережья. Суффикс -енко в этой традиции указывал на родство по отцу и буквально означал «сын кого-то» или «потомок». Так, Ипатенко — это «сын Ипата».

В основе фамилии лежит просторечная форма Ипат от крестильного имени Ипатий. Имя Ипатий пришло из греческого языка, где означало «высочайший» (от слова «ипатос»). В православных святцах это имя носил священномученик Ипатий Гангрский, епископ IV века, почитаемый как защитник веры. В народном обиходе полная форма Ипатий оказалась громоздкой, и её сократили до удобного Ипат — так же, как Евстафий превращался в Остапа, а Иоасаф в Асафа.

Таким образом, фамилия Ипатенко — это не просто отсылка к имени, а указание на конкретного предка по мужской линии, которого в быту звали Ипатом. Встречается она преимущественно в центральных и восточных регионах Украины, где были сильны традиции казацкой старшины и мещанства, а суффикс -енко закрепился как основной способ передачи фамильного прозвания. Родственные фамилии — Ипатов (русская модель на -ов) и Ипатьев (с добавлением -ев к полной форме имени).