Мужское крестильное имя Ипатий в переводе с греческого означает «высочайший». В основу прозвища легла производная форма имени — Ипат. Скорее всего, основатель рода Ипатовых был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Согласно другой гипотезе, фамилия Ипатова образована от прозвища Ипат, которое восходит к аналогичному нарицательному со значением «градоначальник». Соответственно, прозвище содержало указание на род занятий и социальное положение основателя фамилии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ипат, со временем получил фамилию Ипатова.