Фамилия Исаихина указывает на происхождение от имени Исай — разговорной формы библейского имени Исайя. В переводе с древнееврейского оно означает «спасение Господне». Пророк Исайя известен, в первую очередь, своими пророчествами о Мессии, а также идеями социальной справедливости. Он автор библейской книги Исайи; день памяти в православной церкви — 9 мая (22 мая по старому стилю).

В основе фамилии лежит не само имя, а прозвище Исаиха. Так в русской деревне называли жену человека по имени Исай. Суффикс -их- в русских фамилиях указывает на принадлежность к определённой семье или роду: Исаиха — жена Исая, а Исаихин — «чей?» — из дома Исаихи. Такая модель образования фамилий (на -их/-ых) типична для северных и центральных губерний России, в частности для Вятки, Архангельской и Вологодской областей. В отличие от «великорусских» фамилий на -ов/-ев или -ин, которые часто давались по отцу, фамилии на -их фиксировали принадлежность к целому роду или двору. Поэтому Исаихины — это потомки, вероятно, из северорусской крестьянской среды, где прозвище жены становилось родовым именем.