Фамилия Истомаловых — редкий случай, когда этимология уводит не в славянские прозвища, а в восточную ономастику. В основе лежит имя Истомал, которое исследователи связывают с тюрко-персидским составным именем Истамали. Первая часть, «истам», восходит к персидскому слову со значением «остающийся» или «пребывающий». Вторая часть — «али» — искажённая форма арабского «гали», то есть «великий, возвышенный, могучий». Складываясь, эти корни дают смысловую картину: «тот, кто всегда силён и мужествен», «пребывающий в величии». Имя Истомал, таким образом, — это стяжённый вариант более полного Истамали, адаптированный в русской бытовой речи.

Суффикс -ов в фамилии указывает на типичную модель русской патронимии: Истомалова — буквально «дочь (или жена) Истомала». Со временем фамилия закрепилась в наследственном употреблении. Примечательно, что носители фамилии традиционно связаны с Северным Кавказом. В документах Чеченской Республики зафиксированы Науради Нажаевич Истомалов (1948 г.р.), Шарани Истомалов (1933 г.р.) и Деши Сайдахмадовна Истомалова (1940 г.р.). Эта географическая привязка не случайна: именно в регионах с сильным тюркским и персидским влиянием подобные имена переходили в фамилии при оформлении русского делопроизводства.

Однокоренных фамилий в русском ономастиконе почти нет — это выделяет Истомаловых из ряда. Спорной остаётся версия о связи с древнерусским глаголом «истомить» (измучить): она проста и лежит на поверхности, но не объясняет ни кавказского ареала фамилии, ни структуры имени Истомал, где нет типичных славянских суффиксов. Поэтому версия о восточном происхождении выглядит убедительнее. Точное время появления фамилии установить сложно: процесс её закрепления шёл долго, и окончательные выводы требуют глубоких генеалогических изысканий.