Фамилия Истоминова — женская форма от Истомин, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса, который сразу выдаёт происхождение. Суффикс -ов- (в женском варианте -ова) указывает на типичную русскую патронимическую модель: Истомин — значит «сын Истомы». Это не отчество в современном смысле, а указание на отца или главу семьи, которого в народе звали прозвищем Истома.

Основа фамилии — прозвище Истома. В древнерусском языке «истома» означала усталость, изнеможение, томление. Прозвище могли дать медлительному, вялому человеку или тому, кто часто жаловался на усталость. Но есть и другая версия, не менее правдоподобная: в некоторых говорах «истома» — это ласковое обращение, почти синоним «милый», «родной». В таком случае прозвище могло быть не обидным, а домашним, уменьшительным. Оба значения встречаются в документах XVI–XVII веков, и разделить их по конкретным носителям почти невозможно.

Фамилия Истомин (а значит, и Истоминова) — нередкая, но и не массовая. Она встречается в центральных областях России, особенно в старых писцовых книгах Новгородской и Тверской губерний. Мужская форма Истомин фиксируется в «Ономастиконе» С. Б. Веселовского: он упоминает Истому Борисовича, помещика XV века, и нескольких Истом в XVI веке. Это подтверждает, что прозвище было в ходу среди служилых людей и крестьян.

Интересная деталь: фамилия могла возникнуть и от крестильного имени. В святцах есть имя Истома (редкая форма от Иосиф или Евстафий), но ономасты, например Б. Унбегаун, склоняются к прозвищному происхождению. Если бы это было от имени, форма скорее была бы Истоминский или Истомин с другим суффиксом.

Истоминова — фамилия, которая не даёт однозначного ответа о профессии или сословии предков. Она говорит только о личном качестве или прозвище основателя рода. Носительница этой фамилии может считать, что её предок был либо человеком спокойным, даже флегматичным, либо, наоборот, любимцем в семье — в зависимости от того, какое значение слова «истома» было в ходу в его местности.