Фамилия Истоминский — нечастая, но прозрачная по своему происхождению. В её основе лежит не имя, а прозвище или имя Истома, широко распространённое в допетровской Руси. Истомой называли ребёнка, который родился слабым, болезненным, «истомлённым» (от глагола «истомить» — изнурить, лишить сил). В народе верили, что такое имя, данное как оберег, отведёт от младенца настоящие хвори.

Суффикс -ский указывает на то, что носители фамилии — выходцы из определённой местности или потомки владельца поместья. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ин, фамилии на -ский в старину чаще носили дворяне, духовенство или жители конкретного села. Истоминский мог означать «сын Истомы», но с оттенком принадлежности к месту: «из рода Истомы» или «из села, где жили Истомы».

Географически фамилия тяготеет к западу и северо-западу России. В писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются деревни Истомино в Новгородской, Псковской и Тверской губерниях. Выходец из такого села, переселившись в город, получал прозвище Истоминский — по названию покинутой деревни. Поэтому фамилия могла возникнуть независимо в разных местах, как топонимическая.

Есть и более редкая версия: Истоминский — это вариант фамилии Истомин, но с прибавлением польского или белорусского суффикса -ский, что характерно для шляхты. В Речи Посполитой многие крестьянские фамилии «облагородились» такой приставкой. Однако для русской среды типичнее именно топонимическое происхождение.

Сравните с однокоренными: Истомин, Истоменко, Истомов. Истоминский стоит особняком — он не сын (как Истомин), а «принадлежащий к месту или роду Истомы». В дореволюционных справочниках эта фамилия встречается редко, что говорит о её локальном характере. Если ваши предки носили Истоминских, скорее всего, они происходили из небольшого села на северо-западе России, где фамилия закрепилась за одним-двумя родами.