Фамилия Истомок — редкая и нестандартная. В отличие от привычных Истомин или Истомов, она образована не по модели притяжательного прилагательного («чей?»), а иначе. Суффикс -ок здесь указывает на уменьшительность или принадлежность к чему-то в форме существительного. То есть Истомок — это, скорее всего, прозвище, которое застыло в именительном падеже: «вот идёт Истомок». Такая модель встречается у фамилий, которые когда-то были уличными прозвищами (Жданок, Бурёнок, Козловок).

В основе лежит нецерковное имя Истома. В древнерусском языке «истома» означала усталость, изнеможение, томление. Так могли назвать ребёнка, родившегося слабым, болезненным или долгожданного, от которого «извелась» мать. Имя Истома было распространено в XV–XVII веках, особенно в северных и центральных землях. Встречается оно в актах: например, в новгородских писцовых книгах упоминается крестьянин Истома. Сын такого человека мог стать Истоминым, а внук — Истомковым, но форма Истомок — более архаичная и прямая.

Географически фамилия Истомок привязана к западнорусским и белорусским землям. Вариант с суффиксом -ок характерен для регионов, где сильна польская или украинская ономастическая традиция, но встречается и в старорусских говорах. Возможно, предок носителя фамилии был выходцем из Смоленщины, Брянщины или с Гродненщины.

В словаре Б. О. Унбегауна «Русские фамилии» такая модель упоминается как одна из редких, типичная для прозвищ, перешедших в фамилии без дополнительных суффиксов. Это значит, что Истомок — фамилия, которая почти не изменилась за 300–400 лет.

С точки зрения социального контекста: носитель прозвища Истомок мог быть крестьянином или посадским человеком. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — она осталась в низовых слоях населения, что и объясняет её редкость. Фамилия не «зазвучала» в истории, не попала в гербовники, но сохранила живую память о том, как в деревне называли человека по его имени или состоянию.