Фамилия Истракова — женская форма фамилии Истраков, а та образована от мужского личного имени или прозвища Истрак. В основе, скорее всего, лежит диалектное слово «истрак» — так в некоторых русских говорах называли истому, утомление, либо человека слабого, болезненного. В этом случае прозвище давали не в укор, а по характерной примете: в крестьянской среде до отмены крепостного права такие «говорящие» имена фиксировали внешность или поведение.

Менее вероятна, но возможна версия от тюркского корня. В татарском и башкирском языках есть имя Истрак, восходящее к арабскому «истирака» — «участие», «доля». Носители такой фамилии могли быть выходцами из татарских или башкирских родов, перешедших в православие, — в Поволжье и Приуралье подобные случаи не редкость. Однако для фамилий на -ов/-ев тюркская основа менее типична, чем славянская прозвищная модель.

Суффикс -ов (в женском роде -ова) указывает на принадлежность: Истраков буквально значит «сын Истрака». Фамилия закрепилась в центральных и южных областях России, встречается в архивных записях XIX века по Тульской, Рязанской и Воронежской губерниям. В этих краях слово «истрак» в значении «хилый» действительно бытовало, что подтверждает первую гипотезу.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Истомин, Истомов, — они все идут от того же корня «истома». Истраков стоит особняком: в нём не суффикс -ин, а -ов, и корень звучит твёрже. Возможно, это не прямое прозвище, а переосмысление имени Истома через местный говор: «истрак» как вариант произношения.

Сословная принадлежность предков Истраковых — почти наверняка крестьяне или однодворцы. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не значится. Значит, предки — пашенные люди, чьё прозвище, нелестное на первый взгляд, стало родовым именем.