Фамилия Иваннюк — один из вариантов огромного семейства фамилий, образованных от имени Иван. В русском, украинском и белорусском ономастиконе это имя дало рекордное число производных, и Иваннюк стоит в ряду таких форм, как Иваненко, Иванов, Иванцов, Иванюк. Ключевая черта здесь — суффикс -юк, который в украинской и юго-западной русской традиции указывал на принадлежность или родство: чей? — Иванов сын, то есть «маленький Иван» или потомок человека по имени Иван.

Словообразовательная модель проста: к основе Иван- прибавляется патронимический суффикс -юк (фонетический вариант -ук). Подобные фамилии (Бондарюк, Ковалюк, Михайлюк) характерны для западноукраинских земель, особенно для Волыни, Подолья и Галичины. Встречаемость фамилии Иваннюк выше в западных областях Украины, но носители рассеяны и по Беларуси, и по югу России — туда фамилия попала с переселенцами в XIX–XX веках.

В отличие от русской модели Иванов (чей? — просто «из рода Ивана»), украинский суффикс -юк несёт оттенок уменьшительности или младшего родственника: буквально «Иванёнок», «Иванныч». Поэтому предок носителя фамилии Иваннюк мог быть не просто Иваном, а, скажем, младшим сыном в семье, которого так и звали в обиходе — Иваннюк, то есть «маленький Иван». Со временем прозвище закрепилось за всем родом и перестало осознаваться как уменьшительное.

Стоит отметить, что написание с двумя «н» — Иваннюк — встречается реже, чем вариант Иванюк. Двойное «н» могло возникнуть под влиянием русского правописания (ср. Иван — Иванов) или как диалектная особенность произношения с усилением согласного. В любом случае, это не меняет сути: основа та же, и фамилия остаётся в том же гнезде, что и десятки других «ивановских» фамилий Восточной Европы.