Фамилия Иванюков — яркий пример того, как уменьшительная форма имени превратилась в фамилию целого рода. В её основе лежит каноническое имя Иван (от древнееврейского Йоханан — «Бог помиловал»), но не напрямую, а через производную форму Иванюк. Суффикс -юк в русских фамилиях обычно указывает на «малого», «сына» или «младшего»: Иванюк — это «маленький Иван» или «сын Ивана». Добавление конечного -ов делает фамилию притяжательной, то есть «из рода Иванюка» или «принадлежащий Иванюку».

Интересно, что суффикс -юк особенно характерен для украинской и белорусской ономастики, где он выполняет ту же роль, что и русский суффикс -енко. Это наводит на мысль, что предки носителей фамилии Иванюков могли происходить с западнорусских земель или из Малороссии, а затем, попав в великорусскую среду, их фамилия получила «обрусение» через добавление -ов. В чистом виде фамилия Иванюк встречается на Украине и в Белоруссии, а форма Иванюков — типично русская, закрепившаяся в документах при переписях или переходе на государственную службу.

По социальному составу фамилия неэлитарная: она не встречается среди княжеских или боярских родов. Скорее всего, Иванюковы — потомки крестьян, казаков или мещан. Имя Иван было самым распространённым на Руси, поэтому уменьшительный суффикс помогал различать множество одноимённых людей в одной деревне. Человек по прозвищу Иванюк мог быть младшим сыном Ивана, либо просто носителем ласкательной формы имени.

В написании фамилии возможны варианты: Иванюков и Иванюков (ударение, как правило, падает на последний слог — Иванюко́в, хотя в некоторых говорах может смещаться на второй). Редкое, но существующее написание через «а» — Иванюкав — встречается в южнорусских диалектах, где «о» в безударной позиции редуцируется. В целом, фамилия Иванюков — наглядный пример смешения языковых традиций: украинская основа, русский суффикс и общая для всех славян модель «имя + патронимический суффикс».