Фамилия Изотин — одна из тех, что образованы от крестильного имени. В её основе лежит мужское имя Изот, которое является народной формой церковнославянского имени Зотик. Греческое слово, лёгшее в основу, означает «животворный» или «дающий жизнь». Так что в буквальном смысле фамилия указывает на предка по имени Изот.

С точки зрения словообразования фамилия проста и прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. В древнерусской традиции ответ на вопрос «чей ты?» звучал как «Изотин сын» или просто «Изотин». Такая модель типична для фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на -а или -о (Изот → Изотин). Параллельно существует фамилия Зотиков — от канонической формы имени.

Имя Изот было достаточно распространено в крестьянской среде, особенно на Русском Севере и в центральных губерниях. Это объясняет, почему фамилия Изотины встречается в Вологодской, Архангельской и Костромской областях. Встречаются и более редкие варианты написания — Изотин с ударением на второй слог, а также Изотовы, что указывает на ту же основу, но оформленную другим патронимическим суффиксом.

О точном времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс закрепления наследственных прозваний в разных сословиях шёл с XV по XIX век. Крестьяне получали фамилии массово лишь после отмены крепостного права в 1861 году. Поэтому Изотины могли оформиться как фамилия и в XVII, и в XIX веке — в зависимости от местности и социального статуса конкретной семьи.