Фамилия Каботов образовано от прозвища Кабот. Скорее всего, оно связано с существительным «каботаж» (от исп. саbо – «мыс»), которое было заимствовано из французского языка в значении «прибрежное грузовое судоходство». Исходя из этого, можно предположить, что основатель рода Каботовых был связан с морским делом. Менее правдоподобной представляется гипотеза, согласно которой, прозвище Кабот ведет свое начало от французского слова cabot – «дворняга, беспородная собака». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кабот, со временем получил фамилию Каботов.