Фамилия Кафтаногова — редкий пример русской фамилии, в основе которой лежит не простое прозвище, а целая словесная конструкция. Она образована от прозвища Кафтаног, которое, в свою очередь, составлено из двух слов: «кафтан» и «нога». Кафтаном на Руси называлась верхняя одежда с глубоким запахом и длинными рукавами. О популярности этого вида одежды говорит большое количество пословиц и поговорок: «Худая слава, что без кафтана Савва», «Рад Епифан, что нажил серый кафтан», «Те же кафтаны, да не те карманы», «И кафтан греет, когда шубы нет», «Кафтан кафтаном, а борода даром», «Хоть кафтан и сер, а ум не черт съел», «Пуст карман, да синь кафтан».

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Обычно прозвища, переходящие в фамилии, строятся по схеме «существительное + суффикс» (Кафтанников, Кафтанов). Кафтаног — это сложение двух корней, что встречается реже и выдает либо яркую внешнюю примету, либо шутливую характеристику. Вероятно, прозвищем Кафтаног нарекали человека, который носил длинный кафтан — до пяток, то есть буквально «кафтан до ног». Такая деталь одежды сразу бросалась в глаза и давала повод для закрепления прозвища.

Впрочем, существует и другая версия. Прозвище Кафтаног могло относиться к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности человека. Можно предположить, что основатель рода Кафтаноговых был портным, шьющим кафтаны. В этом случае вторую часть прозвища — «-ног» — стоит трактовать как указание на инструмент или особенность работы: возможно, мастер работал ногами, сидя на низкой скамье и используя ступню для натяжения ткани, как это делали портные до появления швейных машин. Обе версии правдоподобны, но первая — описательная — кажется более прямой и естественной для бытового прозвища.

Фамилия оформлена суффиксом -ов-, который в русской ономастике означает принадлежность: потомок Кафтанога. Женская форма Кафтаногова — это традиционное окончание для фамилий этого типа. Из-за своей сложности и громоздкости фамилия не получила широкого распространения; она скорее локальна и могла закрепиться в одной или нескольких смежных областях. Встретить Кафтаноговых можно в центральных и южных регионах России, где кафтан как одежда сохранялся в крестьянском быту дольше всего. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кафтаног, со временем получил фамилию Кафтаногова.