Фамилия Какурина — это женская форма, а в основе лежит мужское прозвище Какура. Модель образования простая: к основе «Какур-» добавили типичный русский суффикс принадлежности «-ин», который отвечает на вопрос «чей?» и указывает на родство: «сын Какуры» или «жена Какуры».

Прозвище Какура в старину давали полному, крепкому, здоровому человеку — это одна из версий. Но есть и другая, куда более конкретная, связанная с едой. В русских говорах слова «кокура», «какура» означают изделие из теста: яйцо, запечённое в тесте, или ватрушку, какурку. В этом случае прозвище мог получить любитель такой выпечки, пекарь или тот, кто её готовил. Третья версия отсылает к слову «какур» — так называли белый крымский виноград и вино из него. Тогда прозвище могло достаться виноделу или просто любителю хмельных напитков. Из трёх объяснений кулинарное выглядит самым естественным для бытового прозвища, но исключать остальные не стоит — все они имели хождение.

Первое документальное упоминание относится к 1638 году: в Москве записан Какурин Тит Савельев. Это говорит о том, что фамилия бытовала в столице уже в XVII веке. Кроме того, известен род донских дворян Какуриных — значит, среди носителей были и служилые люди, получившие дворянство.