Фамилия Какутин — редкая и неочевидная на слух. Чтобы понять её происхождение, нужно отбросить современное восприятие и всмотреться в словообразовательную модель. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Какутин — это «сын Какуты» или «человек из рода Какуты». Значит, ключ к разгадке — прозвище или имя Какута.

Самая вероятная версия связывает основу с глаголом «какать» в его старом, детском или диалектном значении. В русских говорах слово «какута» или «какуша» могло означать нечто нечистое, грязное, а также так могли в шутку или с укором назвать неопрятного, неаккуратного человека. Прозвища по физическим недостаткам или особенностям поведения были в крестьянской среде обычным делом — они не несли оскорбления, а служили меткой приметой. Какутой могли прозвать неряшливого ребёнка или взрослого, который не следит за собой.

Есть и альтернативная, более редкая гипотеза. В некоторых говорах «какута» — это вид дикой утки, птицы. Прозвища по названиям птиц (Гусь, Воробей, Сорока) широко распространены в русской антропонимии. Если предок получил прозвище Какута за сходство с этой птицей (например, за характерную походку или крик), фамилия получила бы «птичье» происхождение. Но эта версия менее надёжна, так как слово «какута» в значении «утка» встречается редко и локально.

Модель образования «прозвище + -ин» типична для северных и центральных областей России. Какутины могли появиться в среде крестьян или посадских людей, где фамилии закреплялись поздно, в XVII–XVIII веках, и часто отражали бытовые характеристики. Фамилия недворянская, не искусственная — она выросла из живого прозвища, которое дал сосед или священник.

Встречаемость фамилии сегодня невысока. Она рассеяна по разным регионам, но чаще фиксируется в Поволжье и на Урале. Похожие по модели фамилии — Какушин, Какуев, Какунин — подтверждают, что корень «как-» использовался в прозвищной системе русского языка, хоть и не был массовым.