Фамилия Калигины (в мужском варианте — Калигин) образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от прозвища или имени, оканчивающегося на -а, с помощью притяжательного суффикса -ин. Этот суффикс отвечал на вопрос «чей?» и указывал на принадлежность конкретному человеку: сын Калиги, то есть потомок Калиги.

Основа фамилии — прозвище Калига — имеет несколько возможных толкований, и все они по-своему интересны. Самое прямое объяснение лежит на поверхности: в древнерусском языке «калига» означала башмак, сандалию, а также подошву. Прозвище могли дать либо человеку, который постоянно носил заметную обувь, либо, что гораздо вероятнее, сапожнику — башмачнику. Такие «профессиональные» прозвища были в ходу на Руси: человека называли по тому, что он делал или продавал.

Менее очевидная, но тоже документированная версия связана с русскими говорами. В некоторых диалектах калигой называли брюкву. В таком случае прозвище мог получить огородник, выращивавший этот корнеплод, или же любитель каши из брюквы. Эта версия показывает, насколько бытовой и локальной могла быть основа фамилии — слово, понятное только в одной местности, давало прозвище на всю жизнь.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин «притягивает» основу на -а, и фамилия звучит как типичное русское «отчество второго порядка». Если бы прозвище звучало как Калиг (а не Калига), фамилия была бы Калигов — но фиксация именно на -ин указывает на то, что прозвище бытовало в мягкой, «женской» форме, характерной для многих древних русских имён и прозвищ.

О точном месте и времени появления фамилии Калигин сейчас говорить сложно: процесс формирования фамилий у разных сословий растянулся на несколько столетий, и фамилии, образованные от прозвищ, не всегда оставляли письменные следы. Однако можно с уверенностью сказать, что Калигины — это потомки человека, которого в своём кругу знали по характерной черте: либо по ремеслу сапожника, либо по пристрастию к брюкве, либо по необычной обуви.