Фамилия Калюжнов образована от прозвища Калюжа, а оно, в свою очередь, — от диалектного слова «калюга» или «калюжа». В русских говорах так называли мелкое озеро, лужу или яму, наполненную водой. Скорее всего, предок носителя этой фамилии жил в топком, заболоченном месте или рядом с таким водоёмом — за это его и прозвали Калюжей. Прозвище могло отражать и особенности характера: неаккуратность, неопрятность, если человек постоянно ходил грязным или жил в сырости.

Менее вероятная версия связывает фамилию со словом «калуга» — так называют крупную рыбу из семейства белуг. Но это объяснение слабее: географическое прозвище для фамилий такого типа встречается гораздо чаще, чем рыболовное, да и форма «Калюжа» прямо указывает на лужу, а не на рыбу.

По модели образования фамилия типична для восточнославянской традиции: к основе «Калюж(а)» добавили суффикс принадлежности -нов, то есть «сын Калюжи». Со временем прозвище закрепилось за потомками как наследственная фамилия.

Интересно, что у фамилии есть региональный оттенок: слово «калюжа» активно бытует в южнорусских и украинских говорах. Это может указывать на географию происхождения рода — южные области России или территории, граничащие с Украиной. Однокоренные фамилии — Калюжный, Калюжнов — встречаются в тех же краях, что подтверждает связь с местным диалектом.