Фамилия Кандиусов — редкая и неочевидная. В ней нет привычного «Иван — Иванов», и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её основу, а она, скорее всего, не русская, а латинского происхождения.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — Кандиусов). Значит, в основе лежало личное имя или прозвище Кандиус. Само это имя восходит к латинскому candidus — «белый», «сияющий», «чистый», «искренний». В римской традиции это было распространённое родовое имя (когномен), а в христианской культуре — имя нескольких раннехристианских святых. Таким образом, Кандиус — это церковное календарное имя, хоть и редкое. В святцах оно встречается, и крестильное имя Кандид (женская форма — Кандида) давали ребёнку в честь мученика. Фамилия Кандиусов — это русифицированная форма от этого имени: не Кандидов, а именно Кандиусов, что указывает на то, что имя бытовало в народе в форме Кандиус.

Вторая, менее вероятная, версия — искусственное происхождение. В семинарской среде было принято «облагораживать» фамилии, переводя их на латынь или греческий. Если предка звали, скажем, Белов (от «белый»), то при поступлении в духовное училище ему могли дать фамилию Кандиусов — от того же латинского candidus. Однако в этом случае фамилия звучала бы как Кандидов или Кандидский, а суффикс -ус-ов скорее говорит о народной, а не книжной переделке.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Поволжью, где сильны были старообрядческие и казачьи традиции, в которых сохранялись редкие календарные имена. Сословно Кандиусовы могли быть как из духовенства (священники, носившие имя Кандид), так и из крестьян или мещан — в среде простых людей имя Кандиус могло звучать как Канди́й или Канди́ха.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Кандидов, Кандинский, Кандидович) показывает, что Кандиусов — самая русифицированная форма, в которой латинское окончание -ус осталось в основе, но получило славянский суффикс принадлежности. Это редкий случай, когда фамилия сохранила «учёное» звучание в народной среде.