Фамилия Кандиусова — редкий случай, когда основа явно не славянская, а корень, скорее всего, греческий или латинский, прошедший через церковную среду. Модель образования проста: суффикс -ов- указывает на принадлежность («чей?»), а окончание -а — на женский род. Мужской вариант — Кандиусов. Это типичная патронимическая фамилия, то есть образованная от имени или прозвища отца.

Самая вероятная версия связывает основу с латинским словом candidus — «белый», «светлый», «чистый» или «искренний». В православных святцах есть имя Кандид (от того же корня), которое носили несколько раннехристианских мучеников. Однако в русской традиции имя Кандид почти не прижилось, а вот форма «Кандиус» могла возникнуть как семинарская или книжная переделка. В среде духовенства в XVII–XIX веках было принято давать будущим священникам «благозвучные» фамилии на латинский манер: так появлялись Розовы, Адоратские, Спера́нские и, возможно, Кандиусовы. Если предок был семинаристом или священником, фамилия могла означать «сын того, кто чист/бел» — скорее как характеристика души, а не внешности.

Менее убедительная, но возможная версия — прозвище от диалектного слова. В некоторых говорах «кандюк» или «кандык» означало «сосуд», «кувшин» или даже «брюхо» (сравните с украинским «кандюк» — рубец, часть желудка жвачных). Но превращение «кандюк» в «Кандиус» фонетически маловероятно без книжного влияния. Скорее всего, именно латинский корень и церковная среда — главный ключ к происхождению.

Географически фамилия встречается крайне редко и в основном фиксируется в центральных областях России и Поволжье, что косвенно подтверждает её искусственное, «семинарское» происхождение: такие фамилии разносились выпускниками духовных училищ по разным епархиям. В дореволюционных метриках Кандиусовы могли быть как священниками, так и мещанами — дети духовенства нередко уходили в светские сословия.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Кандидов, Кандинский — показывает, что все они восходят к одному латинскому гнезду, но Кандиусов стоит особняком из-за необычного суффикса -ус-, который в русских фамилиях почти не встречается и прямо указывает на латинизированную форму. Это редкий случай, когда фамилия хранит след не крестьянского прозвища, а школьной или церковной традиции XVIII–XIX веков.