Фамилия Канникова — женская форма, а мужская, Канников, образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от прозвища или имени с помощью суффикса -ов. Суффикс указывает на принадлежность: буквально «сын Канника» или «из семьи Канника». Основа здесь — слово «канник», которое в русских говорах имеет несколько значений, и чтобы понять, кем был предок, нужно разобраться в диалектах.

В первую очередь, «канник» — это не просто прозвище, а конкретное ремесло или занятие. В северных и сибирских говорах так называли мастера, который изготовлял каны — большие глиняные горшки или кувшины для молока и кваса. Слово «кан» (от древнерусского «канъ») как раз и обозначало такой сосуд. Соответственно, Канников — это потомок гончара, специализировавшегося на определённом виде посуды. Эта версия кажется наиболее логичной, так как прозвища по ремеслу были массовыми, а суффикс -ник как раз указывает на деятеля.

Вторая, менее распространённая версия, связывает фамилию с диалектным словом «канник» в значении «крикун, горлопан» (от глагола «канить» — кричать, шуметь). В этом случае прозвище давали человеку с громким голосом или сварливому. Однако для фамилий, основанных на ремесле, характерна более устойчивая передача из поколения в поколение, поэтому «гончарная» версия весомее.

Интересно, что фамилия Канников встречается в основном в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской и Архангельской областях, где глиняная посуда была в ходу, а слово «кан» сохранялось в речи дольше всего. Встречается и фамилия Канник (без суффикса), что подтверждает прямое происхождение от прозвища.

В написании фамилии важно не путать её с однокоренной Канниковой, которая могла образоваться от названия населённого пункта Канниково (такие деревни есть в Вологодской и Костромской областях). Но в фамилии Канникова ударение, скорее всего, падает на первый слог — Кáнникова, что тоже указывает на древнюю основу «кан», а не на географическое название.