Фамилия Капаницын — довольно редкая, но её происхождение прозрачно и укладывается в типичную для русского севера и центра словообразовательную модель. В основе фамилии лежит не имя, а прозвище Капаница, которое, в свою очередь, образовано от глагола «капать». Чаще всего так называли человека, имевшего отношение к капели или капле: это мог быть медлительный, неторопливый человек, которого сравнивали с падающей каплей, или же, напротив, человек, который постоянно «капает» — надоедает просьбами, докучает. Однако более конкретная версия связана с ремеслом: «капаницей» в некоторых говорах называли мастера, который капал, то есть выплавлял, дёготь или смолу. Дёготь курили из берёсты, и этот промысел был распространён в лесных северных губерниях — Вологодской, Архангельской, Костромской. В таком случае предок носителя фамилии был смолокуром или дёгтекуром, человеком, чья работа требовала терпения и сноровки.

Суффикс -ын указывает на принадлежность: Капаницын — это «сын Капаницы» или «человек из рода Капаницы». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ на -а (Капаница → Капаницын), и часто встречается в северных и сибирских регионах, где окончание -ин/-ын было особенно продуктивным. В отличие от более распространённых фамилий на -ов, форма на -ын встречается реже, что делает фамилию Капаницын более локальной и привязанной к конкретной местности. В документах XVIII–XIX веков носители этой фамилии встречаются преимущественно среди крестьян и мещан Вятской, Пермской и Вологодской губерний — именно там дёготь и смола были ходовым товаром.

Стоит упомянуть, что существует и менее вероятная версия, связывающая прозвище Капаница с церковным именем Капитон (в народном произношении — Капа). Но в таком случае фамилия звучала бы как Капицын или Капитонов, а форма Капаницын явно указывает на прозвищную основу с активным суффиксом -иц(а). В любом случае, фамилия Капаницын — это не про высокие чины, а про повседневную работу и быт: предок был либо человеком неторопливым, либо, что правдоподобнее, мастером, который «капал» дёготь в лесной глуши.