Фамилия Капанько звучит характерно для украинской ономастики, и её разговорная, почти «домашняя» форма — ключ к пониманию происхождения. Суффикс -ко (в украинском языке он чрезвычайно распространён) обычно указывал на происхождение от прозвища или имени отца: Капанько — это буквально «сын или потомок Капаня» или «человек, относящийся к Капаню».

Основа «Капан-» почти наверняка восходит к глаголу «капать». В славянских говорах прозвище Капань могли дать человеку по нескольким причинам. Первая и самая очевидная — профессиональная: капателем называли мастера, который лудил или паял посуду, заливая швы расплавленным оловом (отсюда и «капанье» металлом). Вторая версия связана с характером или внешностью: так могли прозвать медлительного, вялого человека, который «капает на мозги» нудными разговорами, или того, кто ходит с опущенной головой, словно капает носом. Третья, менее распространённая, — это указание на пьяницу, который «капает» (наливает) себе и другим.

Суффикс -ань- в основе (Капань) — типичный для украинских и южнорусских прозвищ, он придаёт слову оттенок просторечия и ласкательности. В документах фамилия могла фиксироваться в вариантах Капаненко, Капанец, но закрепилась именно форма Капанько, характерная для центральных и восточных областей Украины, особенно Полтавщины и Черкащины. В отличие от фамилий на -енко, которые были массовыми, форма на -ько встречается реже и указывает на более тесную, патронимическую связь с конкретным прозвищем предка.

Если говорить о социальном контексте, то носители фамилии Капанько в XIX веке почти поголовно были крестьянами или казаками, а фамилия эта — не дворянская и не книжная, а «уличная», возникшая в быту. Встречается она и сейчас, но остаётся относительно редкой, что только подтверждает её локальное происхождение от одного прозвищного корня.