Фамилия Капантин звучит необычно для русского уха, и её происхождение, скорее всего, лежит за пределами славянской ономастики. В корне фамилии угадывается основа «капант-», которая отсутствует в древнерусских именах и прозвищах. Поэтому логичнее всего искать её истоки в языках, где такое сочетание звуков встречается естественно.

Наиболее вероятная версия — итальянское происхождение. В итальянском языке слово «capante» означает «вместительный», «ёмкий», а глагол «capire» — «понимать». Фамилия могла образоваться от прозвища, данного либо крупному, дородному человеку, либо, наоборот, смышлёному и понятливому. Суффикс «-ин» в русском окончании — это типичная адаптация иностранной фамилии под русскую грамматику: итальянец Капанте в России становился Капантиным, а со временем форма сократилась до Капантин.

Менее распространённая, но допустимая версия — топонимическая. Фамилия могла быть связана с географическим названием, например, с городом Капан в Армении или с местечком Капанте в Италии. В таком случае Капантин — это выходец из этих мест, «капанский». В пользу этой гипотезы говорит и то, что суффикс «-ин» в русских фамилиях часто указывает на принадлежность к чему-то: Чухлома — Чухломин, Казань — Казанин.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия Капантин стоит особняком. В русском языке нет продуктивного суффикса «-антин», который образовывал бы фамилии от славянских корней. Это дополнительный аргумент в пользу её иноязычного корня. Сравните с редкими фамилиями вроде Лантин или Пантин — они тоже часто оказываются заимствованными или переосмысленными.

О сословной принадлежности носителей фамилии ничего определённого сказать нельзя. Если предки были итальянцами, то среди них могли быть и купцы, и мастера-строители, и художники, приезжавшие в Россию в XVIII–XIX веках. Если же корень армянский, то фамилия могла принадлежать дворянам или купцам из Закавказья. В любом случае, фамилия Капантин — яркий пример того, как русская фамильная система «приручила» чужое слово, сделав его своим.