Фамилия Капейка звучит как прозвище, и это первая и самая очевидная версия её происхождения. В основе лежит слово «копейка» (в старом написании — «копейка»). Прозвище Капейка могли дать человеку бережливому, скуповатому или, наоборот, тому, кто торговал мелочью, занимался разменом денег. В крестьянской среде прозвища, связанные с деньгами, часто носили ироничный оттенок: Капейкой могли назвать бедняка, у которого каждая копейка на счету.

Менее распространённая, но правдоподобная версия — происхождение от имени или прозвища Капа. В некоторых говорах «капа» означало «капля» или «шапка», но чаще это была уменьшительная форма имён Каллистрат, Капитон или Капитолина. В таком случае фамилия Капейка — это не прозвище, а патроним, образованный через суффикс -к(а): «сын Капы». Однако такая модель образования (с суффиксом -ка) для русских фамилий редка, она больше свойственна украинской и белорусской традиции.

Фамилия Капейка бытует в основном в западных регионах России, а также в Беларуси и на востоке Украины. В этих местах она могла возникнуть и как чисто прозвищная, и как патронимическая. Важно отметить, что в украинском языке слово «капейка» тоже означает копейку, поэтому смысловая нагрузка сохраняется.

В русской ономастике фамилии, образованные от названий денежных единиц (Гривенник, Алтынов, Полушка), встречаются, но Капейка стоит особняком из-за своей формы. Если бы фамилия оканчивалась на -ов или -ин (Капейкин, Капейков), это был бы стандартный русский вариант. Форма Капейка без суффикса — явный признак того, что фамилия закрепилась в том виде, в каком её дали как прозвище, и не прошла через типичную модель перехода в фамилию с помощью притяжательного суффикса. Это говорит о её относительно позднем оформлении или о польско-литовском влиянии, где такие «голые» прозвищные фамилии — обычное дело.