Фамилия Капина — классический пример того, как русская фамилия образовалась от прозвища через притяжательный суффикс -ин. Модель проста: если предка звали Капа, то его дети и внуки становились Капиными. Суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Капин), а окончание -а в современной форме закрепилось по женскому роду или как падежная форма, но в быту фамилия давно воспринимается как неизменяемая.

В основе прозвища Капа лежит старинное слово «капа» (или «капь»). В русских говорах так называли меру сыпучих тел, чаще всего хлеба, а также образцовую гирю для проверки весов. Человек с таким прозвищем, скорее всего, имел прямое отношение к торговле или хлебопечению: мог быть торговцем зерном, мукой, пекарем или даже сборщиком податей, который оперировал этой мерой. Прозвище могли дать и за то, что человек сам был похож на гирю — коренастый, плотный, основательный.

Версия происхождения от церковного имени Капитон (разговорная форма Капа) менее вероятна. Если бы фамилия шла от имени, она чаще встречалась бы в форме Капитонов. Форма Капина с суффиксом -ин типична именно для прозвищ, образованных от нарицательных слов, а не от полных крестильных имён.

Фамилия нередкая, но не массовая. Встречается в центральных областях России и на Урале, где традиционно была развита торговля хлебом. Встречаются варианты написания с одной «п» — Капина, что для фамилий на -ин абсолютно нормально и не меняет их происхождения.