Фамилия Капицина — женская форма, мужская же будет Капицин. В основе почти наверняка лежит прозвище или мирское имя Капица. Это слово в русских говорах означало «шапка, колпак» или «головной убор необычной формы». Человек, носивший такую шапку — постоянно или отличавшийся ею от других — получал прозвище Капица. Отсюда и фамилия: «чей?» — Капицин, то есть сын или потомок Капицы.

Модель образования проста и прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность к роду. Такие фамилии типичны для северных и центральных областей России, где прозвища на -а, -я были особенно распространены. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от полных крестильных имён, Капицин (и Капицина) — яркий пример прозвищной фамилии, связанной с внешностью или привычкой.

Интересно, что слово «капица» могло иметь и уменьшительно-ласкательный оттенок — так называли маленькую шапку или чепец. В некоторых диалектах «капица» — это ещё и колпак для свечи, нагарник. Но основная версия — головной убор. Фамилия редкая, её носители, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды, где прозвища давали по самым заметным бытовым приметам.