Фамилия Капко — украинская по происхождению, что сразу видно по суффиксу -ко. В украинской ономастике этот суффикс — один из самых распространённых: он присоединялся к прозвищам, именам или названиям профессий и закреплялся за потомками как фамилия. В основе фамилии лежит украинское нарицательное «капка», то есть «капля». Прозвище Капко, скорее всего, давали маленькому ребёнку или человеку невысокого роста — по аналогии с чем-то крошечным, как капля. Впрочем, не исключён и переносный смысл: так могли назвать и плаксивого, «капающего слезами» малыша.

Ударение в фамилии, как и в большинстве слов с суффиксом -ко, падает на первый слог: Ка́пко. Фамилия не склоняется в мужском и женском варианте, что типично для украинских фамилий на -о.

Интересно, что в русском языке есть схожая фамилия Капкин, образованная по модели -ин, но Капко сохранила именно украинский суффикс, который не указывает на принадлежность (как -ин или -ов), а фиксирует прозвище целиком. Это значит, что предок носителя фамилии был известен именно как Капко, а не как «сын Капки».

Встречается фамилия в основном на западе и в центре Украины, реже — в южных областях России, куда переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках. Сословной привязки нет: Капко могли быть и казаками, и крестьянами, и мещанами — прозвище не несёт социальной окраски.