Фамилия Капот — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, связано не с профессией или именем, а с внешностью или манерой поведения. В основе лежит слово «капот» — старинный вид верхней женской одежды, просторный халат или плащ с капюшоном. В народной речи «капотом» могли назвать и неуклюжий балахон, и нечто мешковатое. Отсюда прозвище Капот — человек, который носил такую одежду, либо, по переносному значению, неповоротливый, медлительный или неряшливый в одежде человек.

В русской ономастике фамилия Капот стоит особняком. Она образована без типичных фамильных суффиксов, то есть прозвище перешло в фамилию в чистом виде, без добавления -ов, -ин или -ский. Такая модель встречается у так называемых «нестандартных» фамилий, которые чаще фиксировались на севере и в Сибири, где фамилии нередко записывали так, как звучало прозвище. В центральной России прозвище Капот скорее получило бы суффикс и стало Капотовым.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с французским capote (военный плащ-капюшон). Но для крестьянской среды XVIII–XIX веков это маловероятно — французское слово могло проникнуть через дворянский быт, но вряд ли закрепилось как прозвище простолюдина. Поэтому первая версия, от русского «капот» как одежды, надёжнее.

Встречается фамилия Капот крайне редко. По современным данным, носители живут в основном в центральных областях России, а также на Украине. Фамилия не имеет отношения к автомобильной детали — это омоним, возникший в русском языке лишь в XX веке.