Фамилия Капшова — редкий случай, когда географию происхождения можно определить почти безошибочно. Её основа — топоним Капша, а именно река в Ленинградской области, правый приток Паши (бассейн Свири). Вдоль Капши издавна стояли деревни, а жителей этих мест в русских говорах называли капша́нами или капшаками. Фамилия Капшов (а от него женская форма Капшова) — это, скорее всего, притяжательное прилагательное, отвечавшее на вопрос «чей?»: сын Капшана, то есть выходца с Капши.

Мужской вариант, Капшов, образован по продуктивной модели с суффиксом -ов, но сама основа необычна. В отличие от фамилий на -ов от имён (Иванов, Петров) или профессий (Кузнецов), здесь в основе — гидроним. Такое встречается реже и обычно указывает на переселенцев: человека прозвали не по отцу, а по месту, откуда он пришёл. Если бы предок остался жить на той же реке, прозвище было бы излишним — оно закреплялось за теми, кто уехал и стал «чужаком» на новом месте.

Вторая, менее вероятная версия, выводит фамилию из прозвища Капша. В тверских и псковских говорах «капша» — это нерасторопный, медлительный человек (от глагола «капшить» — мешкать). Однако в таком случае фамилия могла бы встречаться шире, а она явно тяготеет к северо-западу России. Кроме того, суффикс -ов в прозвищных фамилиях стандартен, но сочетание «Капш-ов» как раз и наводит на мысль о топониме: река Капша даёт прилагательное «капшовский», а в бытовой речи оно сократилось до Капшов.

Женская форма Капшова — это не отдельная фамилия, а грамматический вариант, закрепившийся в официальных документах. В дореволюционной России женщинам часто записывали фамилию мужа или отца в женском роде, и эта практика перешла в паспортную систему. Носительницы фамилии Капшова с высокой вероятностью имеют предков из бассейна Свири — современные Тихвинский район Ленобласти или соседние территории Вологодчины. Других крупных очагов фамилии ономастика не фиксирует.