Фамилия Капусин — редкий случай, когда внешне прозрачная форма скрывает неожиданный корень. На первый взгляд кажется, что в основе лежит «капуста»: суффикс -ин указывает на принадлежность, и фамилия читается как «чей?» — «капустин», но с утратой буквы т. Такое фонетическое упрощение (выпадение согласного в скоплении «ст») вполне естественно для живой речи: «Капусин» вместо «Капустин». Однако это лишь первая и самая простая версия.

Если копнуть глубже, обнаруживается другая линия. В старых русских говорах и актовых документах XVI–XVII веков встречается прозвище Капуста — его давали не только огороднику, но и человеку с круглой, плотной фигурой или медлительному, «квашней». От этого прозвища по модели «чей сын?» образовали фамилию Капустин. Капусин же мог возникнуть из того же источника, но уже в местности, где конечное «-ин» присоединили к основе «Капус-», отсекши «т» как лишний звук. Такое встречалось в северных и сибирских говорах, где любили упрощать произношение.

Третья, менее очевидная версия — связь с диалектным словом «капуса» (капризный, плаксивый человек) или с глаголом «капусить» (пачкать, портить). В этом случае Капусин — потомок человека, которого дразнили за неряшливость или ворчливость. Версия не массовая, но для редкой фамилии вполне реальная.

Сам суффикс -ин типичен для русского Севера и центральных областей: он образовывал притяжательные фамилии от основ на -а, -я. То есть географически Капусины, скорее всего, вышли из зоны, где преобладала эта модель, — Вологодчина, Архангельская губерния, Поволжье. Сословного барьера фамилия не имела: её мог носить и крестьянин, и мещанин, и служилый человек по прибору.

В итоге: Капусин — либо вариант фамилии Капустин с утраченным «т», либо самостоятельное образование от прозвища Капуса. Второе правдоподобнее именно из-за редкости формы: если бы все Капусины были просто «капустниками», фамилия встречалась бы гораздо чаще. Значит, предки носителя этой фамилии могли быть не огородниками, а людьми с характером — ворчливыми или неопрятными, но запомнившимися округе настолько, что прозвище перешло в наследство.