Фамилия Капутовский — один из тех случаев, когда внешне прозрачная основа обманчива. На первый взгляд, корень «капут» ассоциируется с латинским caput («голова») или немецким Kaputt («разбитый, конец»). Но ни одна из этих версий не выдерживает критики: фамилия образована по типичной восточнославянской модели на -овский, которая указывает либо на географическое происхождение, либо на принадлежность к шляхетскому роду. Немецкое слово kaputt пришло в русский язык слишком поздно (через польское посредство в XVIII–XIX веках), чтобы лечь в основу фамилии, а латинский корень в чистом виде для русских фамилий нехарактерен.

На деле перед нами топонимическая фамилия. В Польше, Беларуси и на Западной Украине есть несколько деревень и урочищ с названием Капутово, Капутов или Капуты. Человек, переехавший из такого места, получал прозвище «Капутовский» — то есть «выходец из Капутова». Суффикс -ск- традиционно маркировал дворянские или шляхетские фамилии в Речи Посполитой, но со временем он распространился и на крестьян, особенно после разделов Польши, когда многие семьи записывались по месту жительства. Поэтому носитель фамилии Капутовский мог быть как мелким шляхтичем, так и крестьянином, получившим фамилию при переписи.

Само название Капутово, скорее всего, происходит от прозвища Капут или Капута. В диалектах польского и белорусского языков «капута» — это вид короткой верхней одежды, кафтан. Вероятно, основатель села или его владелец носил такое прозвище из-за характерной одежды. Менее вероятно, но тоже возможно, что в основе лежит диалектное «капать» (капать, течь) — так могли назвать сырое место или болото.

Фамилия редкая, встречается в основном в западных областях России (Смоленская, Брянская), в Беларуси и на востоке Польши. В центральной России она почти не фиксируется — это дополнительный аргумент в пользу польско-литовского происхождения. Варианты написания (Капутовски, Капутовский) не меняют сути: это всегда фамилия, привязанная к конкретному географическому пятну на карте, а не к латинской или немецкой лексике.