Фамилия Капутский звучит необычно и даже тревожно для русского уха из-за прямого созвучия с латинским caput — «голова» и немецким Kaputt — «разбитый, испорченный». Но её происхождение лежит в совершенно другой, бытовой плоскости, и к «концу» или «капуту» она отношения не имеет.

Скорее всего, в основе фамилии лежит не латинский или немецкий корень, а старинное русское слово «капут» или «капута». В южных и западных говорах России так называли капюшон, башлык или головной убор вроде колпака. «Капутой» могли прозвать человека, который постоянно носил такой капюшон, шил их или торговал ими. Прозвище закреплялось за ремесленником или просто за тем, кто выделялся своей одеждой.

Модель образования типична для польской, украинской и южнорусской ономастики: суффикс -ский указывал на принадлежность к месту или роду занятий. Капутский — буквально «относящийся к Капуту» или «сын Капуты». Это не дворянский маркер, хотя в Речи Посполитой шляхта часто носила фамилии на -ский. В крестьянской среде такой суффикс тоже был распространён, особенно у тех, кто переселялся и получал фамилию от имени отца или прозвища.

Менее вероятная, но допустимая версия — топонимическая. Существует село Капуты в Беларуси (Витебская область) или Капутово на Украине. Человек, переехавший из такого места, мог получить фамилию Капутский. В пользу этой гипотезы говорит тот факт, что фамилия встречается в основном в западных регионах России, Беларуси и на Украине, а не в центральных или северных.

Что касается немецкого kaputt, то это заимствование пришло в русский язык поздно, в XVIII–XIX веках, и вряд ли легло в основу фамилии. Скорее всего, это случайное совпадение, которое вызывает лишние ассоциации. Фамилия Капутский — редкая, и её носители, вероятно, происходят из крестьян или мещан западных губерний. Если искать однокоренные фамилии, то это Капутов, Капутин, Капутовский — все они восходят к тому же головному убору.