Фамилия Капутина — женская форма, а её основа, мужская фамилия Капутин, образована по самой частотной русской модели: от прозвища или имени, оканчивающегося на согласный, с помощью суффикса -ин. Этот суффикс, как и -ов/-ев, указывал на принадлежность: «чей сын?» — Капутин, то есть сын Капуты. В основе, таким образом, лежит прозвище Капута.

Что означает слово «капута»? В русских говорах и в просторечии так называли неудачника, человека, который «пропал», «капут» которому. Слово «капут» пришло из немецкого (kaputt — разбитый, погибший) через солдатский жаргон или торговые контакты. Прозвище Капута могли дать человеку, который постоянно попадал в неприятности, терпел неудачи, или же, наоборот, в шутку — тому, кто «доканывал» других. Вторая, менее распространённая версия, связывает прозвище с глаголом «капать»: Капута — тот, кто капает, например, нудный, надоедливый человек. Но связь с «капут» выглядит убедительнее: она объясняет резкое звучание и экспрессивную окраску.

Фамилия Капутин (и Капутина) — редкая. Она не входит в списки самых распространённых русских фамилий, не привязана к конкретному региону или сословию. Скорее всего, она возникла в среде крестьян или мещан, где прозвища были особенно меткими. Встречается она и в других славянских языках, например, польском (Kaputa), что подтверждает её общеславянский характер. Интересно, что в некоторых диалектах «капутой» называли также вид головного убора, но это значение локально и вряд ли стало основой для фамилии.

Таким образом, предки носителей фамилии Капутина, скорее всего, получили своё прозвище за невезучий характер или за манеру поведения, которая ассоциировалась с «концом» или «крахом». Это яркая, выразительная фамилия, которая сохранила в себе отголосок простонародного юмора и живой русской речи.