Фамилия Каракушян — яркий пример армянской модели образования фамилий, привязанной к тюркскому прозвищу. Её основа — слово «каракуш» (от тюркского «кара» — «чёрный» и «куш» — «птица»). В тюркских языках «каракуш» означает крупную хищную птицу — орла, ястреба, грифа. Это было распространённое прозвище, которое давали человеку за схожие черты: зоркость, хищность, властность, чёрный цвет волос или просто за любовь к охоте с ловчими птицами.

Армянский суффикс -ян (а также его варианты -янц, -енц) означает принадлежность к роду, потомка. Каракушян — буквально «из рода Каракуша» или «потомок Каракуша». Это типичная патронимическая модель, по которой в Армении образовано большинство фамилий. Важно, что армяне могли получить такое прозвище в условиях многовекового соседства с тюркоязычными народами (турками, азербайджанцами, татарами), и оно не обязательно говорит о тюркском происхождении самого предка — скорее о бытовом двуязычии и заимствовании прозвищ.

Географически фамилия Каракушян встречается среди армян, исторически живших в Западной Армении (на территории современной Турции), а также на Кавказе, в частности в Нагорном Карабахе и Армении. Встречается и более редкий вариант написания — Каракушьян, с сохранением мягкого знака перед суффиксом, что отражает особенности произношения в некоторых диалектах.

Сравнение с однокоренными фамилиями других народов помогает понять модель. У русских есть фамилия Каракушев (с суффиксом -ев), у азербайджанцев — Каракушов (с тюркским суффиксом -ов), у турок — Каракуш (без суффикса). Армянский вариант Каракушян стоит особняком именно благодаря своему родовому суффиксу, который делает фамилию не просто прозвищем, а указанием на целый род. Носитель такой фамилии с большой вероятностью — потомок человека, которого в своём селе или городе знали под прозвищем Чёрный Орёл.