Фамилия Карапетяан — редкий графический вариант распространённой армянской фамилии Карапетян. Разница в написании всего в одну букву (двойная «а» вместо «я» на конце) не меняет ни происхождения, ни значения, но указывает на возможную особенность передачи фамилии в документах или на сознательную адаптацию при переезде. Встречается такой вариант крайне редко, в основном среди потомков армянских эмигрантов, которые записывали фамилию на слух в странах, где не было буквы «я» (например, в англоязычной среде), а затем при обратной русификации оставляли двойное «а».

Основа фамилии — древнее армянское имя Карапет (Կարապետ). В переводе с армянского оно означает «предтеча», «предвестник» и является прямым церковным именем: так называют Иоанна Крестителя в армянской апостольской традиции (Сурб Карапет). Имя было исключительно популярно в Армении, и многие фамилии образованы от него с помощью патронимического суффикса -ян (или его варианта -янц). Суффикс -ян означает «из рода», «принадлежащий»: Карапетян — «из рода Карапета», то есть потомок человека по имени Карапет.

Армянские фамилии на -ян — самая массовая модель, они покрывают более 70% всех армянских фамилий. Вариант Карапетяан с двумя «а» на конце — это не самостоятельная словообразовательная норма, а орфографический сбой или калька с латинской транскрипции (Karapetyaan). В самой Армении такое написание не встречается, и носители этой формы, скорее всего, происходят из среды, где фамилию записывали не по-армянски, а по-русски с ошибкой или по-европейски, а затем привели к русскому виду, сохранив двойное «а».

Значение фамилии — указание на предка-священнослужителя или просто на человека с именем Карапет. В армянской культуре это имя не было исключительно духовным, его давали и мирянам, поэтому предок носителя мог быть кем угодно: крестьянином, ремесленником, торговцем. Фамилия не указывает на сословие, но говорит о крепкой связи с армянской церковной традицией — имя Предтечи в Армении почитается особенно, ему посвящены монастыри и храмы.

Однокоренные фамилии — Карапетян (основной вариант), Карапетянц (старая форма с архаичным суффиксом), Карапетов (русифицированный вариант). Все они восходят к одному и тому же имени, и разница в суффиксе — лишь вопрос времени и места записи.