Фамилия Каратикенов — редкая и при этом прозрачная по составу. Её основа — «каратикен» — почти наверняка тюркского происхождения. В тюркских языках (особенно в казахском, киргизском, татарском) слово «кара» означает «чёрный», а «тикен» — «колючка», «шип» или «репейник». Таким образом, Каратикен — это «чёрная колючка» или «чёрный репей». Вероятно, так могли прозвать человека за колючий характер, неуступчивость или за внешнее сходство с репейником — цепкого, настойчивого, кого трудно «отодрать». Либо прозвище носило охранительный смысл: в традициях многих народов имя-оберег давали, чтобы отпугнуть злых духов неприглядным значением.

Модель образования фамилии — суффикс -ов, самый распространённый в русской фамильной системе. Это значит, что основатель рода нёс прозвище Каратикен, а его потомки стали Каратикеновыми — «дети Каратикена». Фамилия закрепилась, скорее всего, в среде крещёных тюркских народов (например, у казанских татар, башкир или ногайцев), которые входили в состав Российской империи и перенимали русскую модель фамилий. Географически фамилия встречается в основном в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — регионах, где издавна соседствовали русские и тюркские общины.

В отличие от фамилий на -ин или -ский, Каратикенов сохранил исходную основу почти без изменений, что указывает на относительно позднее оформление — в XVIII–XIX веках. Встречаются варианты написания с одной «к» (Каратикенов) и с двумя (Караттикенов), но основной корень остаётся тем же. Носителей фамилии немного, и это делает её своеобразным маркером: если вы встретили Каратикенова, то с высокой вероятностью он из семьи, где помнят о тюркских корнях и о прозвище, которое когда-то звучало как «чёрный репей».