По одной из них, эта фамилия образована от мирского имени Карп, данного по названию рыбы. Согласно другой версии, в основе фамилии лежит каноническое мужское имя Карп (от греческого «karpos» – «приносить пользу»). Фамилия Карпукова представляет собой отчество второго порядка: Карп – сын Карпука, внук Карпукова. Суффикс –ук в данном случае может указывать на западно-украинское происхождение фамилии.