Фамилия Карпуша образована от уменьшительной формы канонического мужского имени Карп (от греческого karpos — «плод»). Вопреки распространённому заблуждению, к названию рыбы «карп» она никакого отношения не имеет. Имя Карп было хорошо известно на Руси благодаря св. Карпу, одному из семидесяти апостолов, и его производные формы — Карпуня, Карпуха, Карпуша — встречались в народе повсеместно.

Суффикс -уш- в фамилии Карпуша — типичный для русских обиходных имён ласкательный или просторечный формант (сравните: Ванюша, Мишута, Петруша). Такие формы часто становились основой для фамилий, закрепляя за человеком прозвище по имени отца или его самого. В данном случае фамилия могла возникнуть двумя путями: либо как прямое прозвище человека по имени Карпуша, либо как «дедичество» — то есть указание на внука или сына Карпуши (без дополнительного суффикса -ов/-ин, что для русской ономастики редкость, но встречается в северных и южнорусских говорах).

Фамилия Карпуша относится к «полуотчественным» или «бессуффиксным» моделям, когда прозвищная форма застыла без патронимического окончания. Это указывает на то, что предок носителя, скорее всего, был простого звания — крестьянин или ремесленник, — и фамилию ему дали по обиходному имени, не добавляя «-ов» или «-ин». В документах XVII–XVIII веков такие формы фиксировались реже, чем стандартные отчества, но в устном быту они были обычны.

Географически фамилия Карпуша встречается преимущественно в южных и центральных областях России, а также на Украине, где имя Карп было особенно популярно. В отличие от фамилий Карпов или Карпухин, она не получила массового распространения, что делает её более редкой и локально привязанной. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать корни в среде сельских жителей, где имя Карп передавалось из поколения в поколение, а прозвище по нему закрепилось как родовое.