Фамилия Карпушинская — это женская форма от мужской фамилии Карпушинский, а та, в свою очередь, образована от топонима с суффиксом -ск-. Такая модель типична для польской, украинской и белорусской шляхты, а также для русского духовенства: от названия села, местечка или усадьбы. Исходный топоним — скорее всего, Карпушино или Карпушин. Таких деревень немало на западе России, в Беларуси и на Украине, и все они ведут название от прозвища или имени Карпуша — уменьшительной формы канонического имени Карп.

Само имя Карп (от греческого karpos — «плод») было в ходу у всех сословий, но в крестьянской среде оно давало множество производных. Карпуша — одно из них, такое же, как Ванюша или Петруша. Соответственно, основатель рода Карпушинских мог получить фамилию по месту жительства или владения: «из Карпушина». Если это польский вариант, то окончание -ский указывает на дворянское происхождение, хотя в XIX веке такие фамилии могли принимать и крестьяне после отмены крепостного права, особенно в западных губерниях.

Менее вероятна, но возможна версия от прозвища Карпуша, означавшего человека невысокого роста или плотного телосложения (от диалектного «карпуша» — коренастый, крепыш). Но суффикс -ский твёрдо привязывает фамилию к географическому названию, а не к личному качеству.

Встречается фамилия в основном в западных регионах России (Смоленская, Брянская области), в Беларуси и на Украине. Встречаются варианты написания с одной «с» — Карпушинская, но исторически двойное «с» в суффиксе -ск- более правильно, так как указывает на принадлежность.

Сословная принадлежность носителей фамилии могла быть разной: от мелкопоместной шляхты до сельских священников и крестьян. Точных данных о конкретном роде Карпушинских без генеалогического исследования нет, но ясно одно: фамилия не случайная, а «географическая», и её носители когда-то жили в местечке или деревне, названной в честь человека по имени Карп или Карпуша.