Мужское крестильное имя Карп в переводе с греческого означает «приносить пользу». В основу фамилии легла производная форма этого имени — Карпушкей. Согласно другой гипотезе, фамилия Карпушкеев образована от прозвища Карпушкей, в основе которого лежит нарицательное «карп» - «рыба, разновидность сазана». Возможно также, что Карпушкеем именовали рыбака или человека, занимающегося разведением карпов. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Карпушкей, со временем получил фамилию Карпушкеев.