Фамилия Картунов — один из тех случаев, когда происхождение упирается в омонимию: прозвище Картун могло возникнуть из двух совершенно разных источников, и каждый ведёт к своей истории.

Первая и самая очевидная версия — связь с картами. Прозвище Картун могли дать заядлому игроку, человеку, который не расставался с колодой. В русских говорах слово «картун» в этом значении не зафиксировано как общеупотребительное, но модель прозвищ по склонностям и привычкам («Пьяница», «Гуляка», «Игрец») типична для XV–XVII веков. Так что Картунов вполне мог быть потомком того, кого в деревне знали как завзятого картёжника.

Вторая версия менее очевидная, но не менее интересная. Она отсылает к книжному делу. Слово «картуш» (через французское cartouche) в старину означало виньетку, орнаментальное украшение в начале или конце главы книги. В просторечии «картуш» могло исказиться в «картун» — так называли человека, который такие виньетки рисовал или вырезал. То есть фамилия могла указывать на профессию: художник-оформитель, гравёр, переплётчик, имевший отношение к иллюминированию рукописей или печатных книг.

Какой из вариантов правдоподобнее? Скорее всего, первый — по частоте. Прозвища по ремеслу, как правило, более прозрачны («Кузнецов», «Плотников»), а «картуш» — слово книжное, малопонятное в крестьянской среде, где фамилии и закреплялись в основной массе. Картёжник — фигура более узнаваемая в любом сословии. Однако полностью исключать вторую версию нельзя: если предки Картуновых были из посадских людей или из среды, связанной с печатным делом, прозвище по «картушу» вполне могло закрепиться.

Фамилия образована по стандартной модели: к основе «Картун» добавили патронимический суффикс -ов, означающий «сын Картуна». Встречается фамилия преимущественно в центральных регионах России и в Поволжье, что косвенно подтверждает её русское происхождение, без иноязычных корней.