Фамилия Карунная — редкая, и её происхождение напрямую связано с прозвищем Карунный, которое имело несколько оттенков значения. В основе прозвища лежит, скорее всего, литовское слово karūna — «корона» или «хоругвь». Это не означает, что предок носителя фамилии был потомком королей. В крестьянской среде прозвища Царь, Король или Коронный встречались довольно часто, и у них была своя логика.

Иногда так называли крестьянских детей в надежде, что они вырастут богатыми и знатными. Взрослый же человек мог получить прозвище Карунный за манеру поведения: надменность, важничанье, кичливость или чрезмерную гордость. Другая версия связывает прозвище с реальным положением дел: Карунным могли назвать богатого, знатного или властного человека, который стремился к власти или уже обладал ею в рамках своей общины.

С точки зрения словообразования фамилия Карунная — это притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?». Суффикс -н- указывает на принадлежность: Карунный — тот, кто относится к «короне» или носит прозвище Карунный. Форма Карунная (женский род) закрепилась, когда прозвище перешло в разряд фамилий и стало наследственным, полностью заменив прежнее родовое имя как в быту, так и в официальных документах. Географически фамилия тяготеет к западным регионам России и Беларуси, где было заметно литовское и польское влияние, что косвенно подтверждает литовский корень слова.