Фамилия Карунус — редкий пример балтийской фамилии, которая не укладывается в один очевидный корень. Специалисты по прусской ономастике предлагают как минимум три версии её происхождения, и каждая из них ведёт к разному портрету предка.

Самая конкретная гипотеза связывает фамилию с профессиональным прозвищем Гауронас. Оно восходит к древнепрусскому gauronas — «охотник на морских котиков». Если это так, то основатель рода Карунус промышлял зверобойным промыслом на Балтийском побережье, где охота на тюленей была привычным, хоть и опасным ремеслом. Фонетическое превращение «Гауронас» в «Карунус» объясняется особенностями диалектного произношения и записи фамилий в метрических книгах.

Вторая версия меняет характер предка с ремесла на темперамент. Прусское garuke или garutis переводится как «горячая голова». В этом случае Карунус — прозвище вспыльчивого, буйного человека, которое закрепилось за родом. Такие именования давали не в обиду, а как точную бытовую характеристику, и они нередко вытесняли исходное имя.

Третья гипотеза отталкивается от личного имени Кариун. Его связывают с прусским глаголом kariaut, у которого два значения: «бороться» и «пахать». Двойственность не случайна: в древних обществах война и земледелие часто обозначались одним корнем. Имя Кариун мог получить ребёнок, родившийся в год военного похода или, наоборот, в мирный сезон пахоты.

Выбрать одну версию сложно: фамилия редкая, и массовые переписи носителей не сохранили географической привязки, которая помогла бы сузить круг. Ясно одно: корни Карунус — в прусской языковой среде, а не в славянской или немецкой. Это значит, что предки жили на территории исторической Пруссии, вероятно, в прибрежных или земледельческих районах, и фамилия зафиксировала либо их занятие, либо яркую черту характера.