Фамилия Каюкалов — редкий пример, где за основу взято не имя и не профессия, а конкретное действие или поведение. Скорее всего, её корень — глагол «каюкать» или существительное «каюка». В южных и центральных русских говорах «каюка» — это плакса, нытик, человек, который постоянно жалуется или клянчит. Прозвище Каюка давали тому, кто часто хныкал, канючил, приставал с просьбами. Суффикс -лов указывает на отчество от прозвища: Каюкалов изначально значило «сын Каюки». Такая модель образования (основа на -а + суффикс -лов) встречается реже, чем обычные -ов или -ин, и характерна для фамилий, возникших от прозвищ на -а, -я (сравните: Коряка — Корякалов, Балалайка — Балалайкалов).

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркским словом «каюк» (лодка, челн). В этом случае Каюкалов мог быть потомком лодочника, перевозчика или того, кто делал лодки. Но для такого значения логичнее ожидать фамилию Каюков или Каюкин. Суффикс -лов здесь выглядит чужеродным: он закрепился за русскими прозвищами, а не за тюркскими заимствованиями. Поэтому версия с «плаксой» надёжнее.

Фамилия крайне редкая. По переписям и телефонным справочникам, основные очаги — Волгоградская и Ростовская области, а также Краснодарский край. Это совпадает с ареалом южнорусских говоров, где слово «каюка» было в ходу. Встречаются также варианты написания Каюкалов и Каюкалов (с ударением на второй слог), но путаницы с другими фамилиями почти нет — настолько она нестандартна.

Социальный состав носителей, судя по доступным данным, преимущественно крестьянский. В XIX веке Каюкаловы числились государственными крестьянами в Воронежской и Саратовской губерниях. Никаких дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. По сути, это прозвище, которое закрепилось за родом и не изменилось при переходе в фамилию.