Фамилия Каюков образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Каюк восходит к слову «каюк» - «речное грузовое судно, род полубарки с двускатной крышей, загнутым носом и каюткой в корме», в южных говорах каюком называли бат, лодку-долбушку, однодеревку без набоев. Вообще все каюки изначально строились из однодеревок, с набоямя, насадами по борту. Вероятно, прозвище Каюк относилось к числу «профессиональных» именований, указывавших на род занятий человека. Так, например, могли называть корабельщика, строившего лодки или человека, у которого был каюк, лодочника. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Каюк, со временем получил фамилию Каюков. О точном месте и времени возникновения фамилии Каюков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Каюков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.