Фамилия Казачишина — редкий случай, когда географическая привязка важнее, чем прозвище предка. Если бы фамилия звучала как Казаков или Казачихин, её источник был бы очевиден: прямой предок — казак. Но суффикс -ишин указывает на совершенно другую модель образования.

Дело в том, что фамилии на -ишин характерны для северных и северо-западных областей России, особенно для Псковской и Новгородской земель. Это так называемые полупатронимические формы: их строили не от имени отца, а от прозвища матери или жены. Казачишина — женская форма фамилии, образованная от мужской Казачишин. А мужская фамилия, в свою очередь, возникла от прозвища женщины — Казачиха. То есть носитель фамилии Казачишин — это сын (или внук) женщины по прозвищу Казачиха. Прозвище Казачиха могли дать женщине, чей муж или отец был казаком, либо женщине с вольным, независимым нравом, которую в народе сравнивали с казачкой.

Таким образом, основа фамилии — не род занятий самого предка, а семейное положение или характер его матери. Это отличает Казачишину от более распространённых «казачьих» фамилий. Встречается она преимущественно в Псковской области и соседних районах, что подтверждает северную природу суффикса. В южных казачьих станицах такую фамилию почти не найдёшь — там использовали другие модели (Казаков, Казаченко, Казаченков). Поэтому, если ваши предки — Казачишины, их корни, скорее всего, не в Запорожской Сечи или на Дону, а в крестьянских семьях северо-запада России, где прозвище «Казачиха» могло закрепиться за одной женщиной, а потом перешло на всех её потомков.