Фамилия Казначеевская образована от прозвища или профессионального именования Казначей — по роду занятий предка. Это одна из тех фамилий, где за основу взято не личное имя, а должность, причём должность высокого уровня в допетровской Руси.

Словообразовательная модель здесь не самая частая. Суффикс -евск- (с окончанием -ая) указывает на типично дворянскую или шляхетскую модель фамилии — по названию владения или по имени основателя рода, оформленному как притяжательное прилагательное. Фамилии на -ский/-цкий в русской среде долгое время были маркером знатного происхождения, хотя к XVIII–XIX векам их могли принимать и купцы, и духовенство. В случае Казначеевской основа — не географическое название, а должность, что встречается реже, но тоже закономерно: так образовывали фамилии от прозваний людей, занимавших заметное место в иерархии.

Казначей в Московском государстве — не просто хранитель казны. В духовных грамотах московских князей его упоминают наряду с тиунами домосковской Руси; и те, и другие ведали княжескими доходами. При Иване III казначей стал дворовым чином, стоявшим впереди думных дворян. Он управлял Казённым двором (или приказом), собирал пошлины и оброки, вёл книги записи актов на холопство — вероятно, потому что с поступления в холопство взималась особая пошлина. Сбор пошлин вёл за собой и суд над теми, кто их платил, — отсюда широкая судебная компетенция казначея. В XVI веке казначеи были доверенными и приближёнными к царю людьми: их назначали вести переговоры с иностранными послами, как, например, в 1494 году. К середине XVII века, с развитием приказной системы, ведомство казначея сильно сократилось: доходы передали в финансовые приказы, холопьи дела — в Холопий приказ. На должность казначея обычно ставили людей не родовитых, но она открывала путь к боярству. Так что вполне возможно, что основатель рода Казначеевских служил при царском дворе, и его потомки оформили фамилию по модели, подчёркивавшей их статус.

Сама фамилия Казначеевская — женская форма; мужской вариант — Казначеевский. Встречается она нечасто, что тоже косвенно подтверждает её происхождение из относительно узкого круга служилых людей. Прозвище Казначей со временем полностью заменило наследственное имя и в быту, и в документах — так профессиональное прозвание закрепилось в роду навсегда.