Фамилия Кекиш — редкая, но прозрачная по своему происхождению. Её основа, скорее всего, восходит к украинскому или южнорусскому глаголу «кекать» — то есть издавать отрывистый звук, икать или, в некоторых говорах, кричать по-птичьи. Человек, получивший прозвище Кекыш, мог обладать характерной манерой речи, прерывистым голосом или даже картавостью. В западных областях Украины «кекати» означало также «мяукать», что добавляет бытовую, уютную окраску прозвищу — так могли дразнить любителя мяукать или человека с тонким голосом.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Суффикс -ыш в русских фамилиях встречается редко, чаще в прозвищах (Глупыш, Малыш), но в фамилиях он почти не закрепился. Кекиш — это, по сути, застывшее прозвище, которое не получило дополнительного патронимического суффикса (-ов, -ин). Такая форма характерна для фамилий украинского или белорусского происхождения, где прозвища нередко переходили в фамилии без изменений. Сравните с фамилиями Котыш, Лободыр — все они сохранили исходный вид.

Спорных версий здесь немного. Можно было бы связать Кекиш с тюркским корнем «кек» (месть, злоба), но это маловероятно: суффикс -ыш в тюркских языках не образует фамилий, а русская огласовка слова «кек» дала бы форму Кеков или Кекеев. Кроме того, фамилия не встречается в регионах с сильным татарским влиянием — её география скорее привязана к западным областям Украины и прилегающим районам Беларуси.

В дореволюционных источниках фамилия почти не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении. Скорее всего, Кекиш — это фамилия, которая сложилась в среде крестьян или мещан уже в XIX веке, когда прозвища стали записывать в метрики без изменений. Носители фамилии сегодня встречаются единично, в основном на Украине и в южных областях России. Фамилия не угасла, но осталась редкой — и в этом её своеобразие.